脑血管主要的功能是输送血液到脑组织中去，解剖上有问题，而功能上又是如何呢?脑血流情况，脑组织的血供又是如何呢？这就需要功能性检查，目前有TCD和CTP和MTP。
头颅TCD 经颅多普勒简称(TCD)是利用超声多普勒效应来检测颅内脑底动脉环上各个主要动脉血流动力学及各血流生理参数的一项无创伤性血管疾病检查方法。这是直接对颅内血管的流动状态进行观察，近年来在国内外迅速发展，成为目前脑血管疾病诊断的重要手段之一。在TCD的临床应用中，对颅内动脉狭窄的诊断是其最重要的贡献之一，它主要通过血流速度的测定来间接判断血管的狭窄程度。最重要的它是一种功能性判断，有解剖病变提示价值，但并不能由此准确推断病变，并且检查有一定的主观性。一般它只能定性判断，可作为初步检查，定量分析还需要后二者。
CT灌注 CT灌注（CTP）扫描反映了造影剂从进人组织或病灶的瞬间开始一直到大部分离开组织或病灶为止。它反映的是组织或病灶内造影剂的灌注规律，也即在这些组织或病灶内的血流微循环规律。 CT灌注扫描对时间分辨率要求很高，每次扫描之间的间隔不能大于0.5～1秒。造影剂的注射速度也要比CT动态增强扫描快，以保证造影剂在短时间内集团通过需检查的靶器官，避免后处理时的分析错误。CT灌注扫描可以更直接地反映病变组织的循环规律，更加精确地计算组织的灌注量和描绘灌注曲线。观察指标包括：到正常脑白质内的血容量(CBV)、平均通过时间(MTT)和相对局部血容量(rCBV)、峰值时间(MTP)。
MR灌注 MR灌注成像(perfusion imaging，PWI) 与CTP类似。在MRI灌注成像时常用Gd-DTPA造影剂作为媒体。当造影剂在短时间内高浓度通过某一区域的毛细血管网时，我们认为它基本上可代表血流通过的情况。由于顺磁性造影剂Gd-DTPA的磁化率效应，它不但大大缩短T1时间，也缩短T2*时间。用对磁化率效应敏感的梯度回波成像序列进行检测时，不难发现组织内Gd-DTPA的分布和浓聚情况。可获得时间一浓度变化线性相关的曲线。定量观察到正常脑白质内的血容量(CBV)、平均通过时间(MTT)和相对局部血容量(rCBV)。在定量分析灌注时，一般用指示剂(媒体)扩散理论和技术来计算相对局部血容量(rCBV，振幅一时间曲线内的区域)和平均通过时间(MTT，浓度-时间曲线的第一相)。
CTP和MTP均是一种功能成像，有别于以前的检查是解剖成像，它主要反应脑组织的灌注状态，对脑血流、血管的功能有直接显示作用。CTP和MTP均可作定量分析，其结果与图像数据采集质量与软件后处理密切相关，二者各有优劣。