病人应予胃肠道隔离，除一般治疗外，可根据大便细菌培养及药物敏感试验选用适当的抗菌药物作病原治疗。如复方磺胺甲基异唑、氯霉素、庆大霉素及卡那霉素等。亦可应用氨苄青霉素或氧哌嗪青霉素等治疗。中毒性痢疾应予相应的抢救措施，如抗休克、冬眠药物和脱水药的应用等。慢性菌痢可采用保留灌肠的方法治疗。
1.病原治疗（选用氟啶酸、氨苄青霉素、复方新诺明、丁胺卡那霉素等）。 2.中毒型菌痢治疗原则：病原治疗十回圈衰竭和呼吸衰竭治疗。 3.慢性菌痢治疗原则：病原治疗＋对症支持治疗＋并存症治疗。 4.中药治疗。 5.对症支持治疗。
细菌性痢疾用药原则
1.急性菌痢：应用抗生素和其他辅助药为主。 2.急性中毒型菌痢：抗生素联用，积极治疗高热、惊厥、回圈衰竭和呼吸衰竭。 3.慢性菌痢：抗菌药联用、加强支持治疗和合并症治疗的综合治疗。 4.高热和惊厥的治疗：选用安定、苯巴比妥纳、复方冬眠灵等。 5.休克治疗：选用６５４－２或阿托品、低分子右旋糖酐、５％碳酸氢纳、多巴胺与阿拉明、西地兰、地塞米松等。 6.呼吸衰竭治疗：选用２０％甘露醇、地塞米松、可拉明或洛贝林等。 7.ＤＩＣ治疗：选用肝素治疗。 8.中药治疗：黄连、生大蒜、白头翁汤
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