非淋菌性尿道炎主要通过性接触传染，传染源为非淋菌性尿道炎患者和病原体携带者。女性无症状病原体携带者，是最重要的传染源。传染途径包括：
1)、性接触传染： 与患者或病原体携带者性接触，可导致传染。 性关系紊乱，开始性生活年龄过早，不用避孕套，可使发病率升高。
2)、母一婴传染： 母亲为病原体感染者，新生儿通过产道时可发生眼部、咽喉、阴部感染，甚至可引起肺炎。
3)、间接传染： 通过衣物、用具等可导致传染，尤其多见于儿童。未经严格消毒的妇产科检查器械，也可能成为传播媒介。
4)、自体传染： 通过手或污染物可使病原体从生殖道接种到眼睛或咽喉。
