耕牛血吸虫病一般要由兽医人员治疗。畜主将耕牛牵到兽医站或其它指定的地点，兽医人员先测定耕牛的体重，然后对耕牛进行体格检查，根据耕牛的体重确定耕牛的用药量。
畜用吡喹酮粉剂是目前治疗耕牛血吸虫病最长用的药物。这种药治疗效果好、副作用小、使用安全、口服方便、无特殊禁忌症。治疗方法是：黄牛每千克体重30毫克，水牛按每千克体重25毫克，一次喂服。最大用药量黄牛以300千克，水牛以400千克体重为限。
