药物流产可避免对子宫的直接伤害，所以较少引起感染，对于哺乳期妇女和进行剖腹产的女性比较适用。但它也有缺点。首先，成功率仅有85％；其次，疼痛有时更甚手术，而且出血时间长；最后，药流之后，如果子宫内脱膜未完全脱落，则需进一步手术刮宫。
