调节神经功能紊乱的药物有很多种，具体情况如下：1、抗焦虑抑郁药：很多的神经功能障碍，包括交感神经过度兴奋等，引起的心慌、气短、胸闷、肠道功能紊乱、出汗等，都和焦虑抑郁情绪有关系，因此可以用抗焦虑抑郁治疗的方法来进行改善。常用的抗焦虑抑郁的药物，包括氟哌噻吨片、文拉法辛、艾司西酞普兰等，以及其它的一些SSRI类的药物；2、改善睡眠的药物：相当一部分自主神经功能紊乱，是因为睡眠不好而引起来，如苯二氮䓬类的药物、安定类的药物，以及非典型的药物，如右佐匹克隆等，都可以帮助改善睡眠，甚至一些特殊的药如米氮平，三唑仑类的药物，都可以帮助改善睡眠的状况。此外，还有一些药物是针对症状来改善，如患者更容易出现心慌的症状。对于心慌的患者，可以给予更多的美托洛尔、普萘洛尔等药物进行控制，可以得到症状性的改善，从而达到治疗或者调节神经功能障碍的作用。