头疼一个眼睛疼，并没有特异性，常见于以下原因：1、偏头疼：通常病人会出现眼睛疼痛、眶部疼痛，同时伴有一侧头部疼痛、恶心、呕吐、怕光、怕吵，活动后头疼加重，反复发作，发作时间通常是4-72个小时，通常有家族史，部分患者和生理期密切相关；2、颈源性头疼：通常表现为单侧枕部和顶部疼痛，伴有一侧眼部疼痛，需要进行神经阻滞，可以明显缓解头疼，通常与颈椎活动密切相关；3、丛集性头疼：也可以表现头痛、眼睛疼的特点，同时伴有流泪、结膜充血等，与季节相关；4、其他：存在青光眼的患者，眼压增高出现结膜充血、流泪，导致头疼和眼睛疼。