房颤射频消融手术对患者来说有利也有弊，最大的优点是可防止脑栓塞的发生，此外，房颤消融可使患者恢复窦性心律，维持良好的心功能，还可防止脑栓塞的发生。房颤消融同时也存在微小的缺点如手术操作中可能存在心房处消融损伤，使患者心率恢复的同时心功能丧失20%-30%，可形成心包压塞、心房食管瘘、肺静脉狭窄，也可在心房形成疤痕和结痂导致血栓。