非淋菌性尿道炎确诊后，可采用广谱抗生素疗法，规则用药，彻底治疗。治疗后复查病原体为阴性，患者自觉症状完全消失为治愈。本病用药所需疗程较长。患者复查可以做病原体培养及DNA检查，根据检验结果及病人主诉可以明确患者是否复发。非淋球菌尿道炎的主要传播方式是性传播。性伴侣要同时治疗，治疗期间不要同房，避免进食辛辣刺激性食物，多饮水。治愈后避免不洁性生活，这是防止复发的重要途径。