先天性黄疸包含有先天性非溶血和非梗阻性黄疸。主要是干细胞对于胆红素摄取、结合及排泄，由先天性酶缺陷引起黄疸临床较少见，多发生于儿童或青年期人群，均存在家族史，但多数患者的健康状态良好。先天性非溶血性黄疸包括有Gilbert综合征，Dubin-Johnson综合征，Rotor综合征和Crigler-Najjar综合征。其中Crigler-Najjar综合征是最严重的一型，预后较差。