髓母细胞瘤根据肿瘤的大小、肿瘤的播散情况、手术的切除程度可分为两类。肿瘤较大、手术未能完全清除、发生转移的髓母细胞瘤患者，归类于高危组。其他患者归类于中危组。对于高危组而言，五年生存率约为50%左右。目前也有报道，自体干细胞移植支持下的大剂量的化疗，可将五年生存率从50%提高到70%左右。对于中危组的患儿，五年生存率可达到80%以上。随着治疗方法的多样化，髓母细胞瘤的生存率有望得到明显的提高。