乙肝疫苗保护时间一般为10-15年，平均12年左右。注射乙肝疫苗用以使患者产生表面抗体，注射三次后表面抗体阳性率可达95%以上，但抗体随时间逐渐下降，需注意复查，如果抗体滴度降低至一定值，需再次加强。乙肝抗体阳性并不能百分之百保护机体不受乙肝病毒侵袭。如果大量感染乙肝病毒，而抗体恰好处于较低水平，或乙肝病毒株基因型发生变异，仍有感染乙肝病毒风险，但即使抗体处于低水平，也可中和病毒，减少损伤。