目前临床上治疗甲亢的药物包括甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶两种。一般来说，丙硫氧嘧啶通过胎盘比甲巯咪唑少，对胎儿的不良反应相对较小，是孕妇甲亢的首选用药。大多数非妊娠期患者应首选甲巯咪唑进行治疗。在服用抗甲状腺药物的过程中，应定期监测白细胞和肝功能。若白细胞和肝功能无异常，可以继续服用药物，治疗时间大约为1.5-2年。若白细胞和肝功能出现异常，应积极调整药物剂量或者改用放射性碘或手术治疗。