通常捐献骨髓对身体的危害较微弱，可以忽略不计。前期在做造血干细胞移植时，主要是通过骨髓捐助，一般献骨髓量也较多，在操作之前都要给病人预留自己的血液，预留血液的量和采集骨髓量相同，但危害并不是很大。目前医疗水平下，采集骨髓的量已经越来越少，同时会联合采集病人的外周血干细胞。目前造血干细胞移植都是采集部分骨髓，再加上供者的外周血干细胞输注，采集骨髓的量就更少。因此对于供者，通常没有明显危害。采集一般在手术室的局部腰麻下完成，对于供者，捐献骨髓在目前的诊治水平中危害较小。