小腿肌肉疼痛的原因，可能包括以下几个方面：1、乳酸堆积：如果是偶尔跑步、活动、劳力加重之后出现小腿酸痛，可能乳酸堆积情况比较常见，通过休息可以缓解；2、肌纤维织炎：可能为腓肠肌的肌纤维织炎，需要查一下；3、腰椎间盘突出：腰椎间盘突出可能导致腰五神经根出现问题，导致小腿的疼痛；4、下肢血管及：可能是小腿深部的静脉或者动脉血管出问题，导致血管性小腿痛。还有可能是其他疾病造成的疼痛，总体来说，以上几个原因比较常见。如果出现小腿部肌肉明显疼痛、顽固性疼痛，就要去找原因，后面几种都要去医院排查。