奥美拉唑可以在早上空腹服用。奥美拉唑不耐酸，通常制作成肠溶制剂，包括肠溶胶囊、肠溶片。用药要求整粒吞服，避免嚼碎，否则容易免破坏肠溶衣。肠溶衣主要保护奥美拉唑在胃部酸性环境中不崩解，肠溶胶囊进入肠道后在碱性环境崩解，发挥药效。奥美拉唑药物说明书中提到晨起吞服，若疾病治疗需要可夜晚再服用一次，具体服用时间及疗程需遵医嘱。奥美拉唑也可同阿莫西林、铋剂、PPI类药物、克拉霉素等药物进行三联或四联用药，根治幽门螺杆菌。