输尿管软镜常见的手术危害有以下几点：1、输尿管损伤：输尿管软镜在进入输尿管时，需要放置输尿管软镜镜鞘，镜鞘一般盲放，在输尿管镜鞘进入输尿管的过程中有可能会出现输尿管损伤、撕脱，严重时会出现输尿管断裂；所以做输尿管软镜时一般会提前放双J管2周，扩张输尿管，降低输尿管损伤的发生率；2、感染：输尿管镜在碎石过程中由于光纤比较细，所以碎石效率不高，尤其是合并感染性结石或手术时间过长时，会导致机体对细菌的吸收增加，容易引起菌血症或脓毒血症，患者手术之后可能会出现寒战、高热等症状，严重时会出现中毒性休克；3、远期并发症：输尿管软镜远期并发症主要是输尿管狭窄，所以做完手术后需要留置双J管，降低输尿管狭窄的发生率。