扁桃体长溃疡有以下几种原因：1、炎症：在炎症状态下，扁桃体表面可能会形成溃疡，但这种溃疡持续的时间不会太长，经过治疗或身体机能的恢复，溃疡即可修复；2、缺乏维生素、微量元素：经常长口腔溃疡，有些溃疡会出现在扁桃体，或者扁桃体前方的腭咽、腭舌弓上，此时补充维生素C或锌剂，溃疡会迅速愈合；3、恶性淋巴瘤：如果扁桃体出现比较大的溃疡，呈火山口样，溃疡持续时间较长，偶尔还会有破溃、出血，此时要警惕恶性淋巴瘤的可能性，如果怀疑是淋巴瘤，要对扁桃体上的溃疡进行活检，将活检组织送病理切片，以排除恶性淋巴瘤。