中医认为子宫内膜异位症最主要、最根本的病机是血瘀，所以中药口服治疗的时候，常采取活血化瘀的药物，配合行气、补肾、温阳、利湿等中药治疗。除了中药口服治疗，还可以配合外治法，比如中药外敷，口服中药的药渣子可以放在小腹部进行外敷，也能够起到活血化瘀、止痛的效果。还可以采用中药灌肠的方法，中药浓缩制成汤剂，浓缩至100ml左右，缓慢灌入直肠。因为肠道位于盆腔内，药物可以通过肠道直接吸收入盆腔，对子宫内膜异位症也有治疗作用。