胃窦萎缩性胃炎属于萎缩性胃炎的一种，萎缩性胃炎分为胃窦型萎缩和胃体型萎缩。胃体型萎缩性胃炎一般与自身免疫反应有关，但胃窦型萎缩需查有无幽门螺杆菌感染，因胃窦型萎缩与幽门螺杆菌感染以及胆汁反流有关。 因此，针对胃窦萎缩性胃炎患者，建议做胃镜检查。如胃镜显示伴胃黏膜粗糙或小结节，则需取病理，检查有无肠上皮化生或不典型增生。针对早期胃癌筛查，萎缩性胃炎属于重点。治疗上可用保护胃黏膜、抗胆汁反流的药物，中成药可以用胃复春、摩罗丹进行治疗，但重点为随访胃镜病理。