早晨醒来出现头疼，主要原因如下：1、高血压：部分患者可能存在晨起的高血压，监测血压后即可明确诊断；2、上呼吸道感染：部分患者早晨起后出现头疼，也可能前一天晚上受凉出现发热、头痛，属于上呼吸道感染引起的头疼；3、胶质瘤：患者若出现反复晨起头疼，年龄在20-50岁的中青年，常见于胶质瘤；4、脑血管病：若患者突发早晨起头疼，需要当心是否有脑血管病，尤其脑出血、蛛网膜下腔出血。若患者无头疼史或几次连续近期头疼发作，并伴有发热等，建议尽快到医院就诊。必要时进行脑电图、头颅CT、头颅核磁共振检查，进而明确诊断，避免贻误和延迟诊断和治疗时期。