手指间起小水疱有以下原因：1、汗疱疹：最多见，汗疱疹是特殊类型的湿疹，由于过敏导致，所以需要应用抗过敏药物进行治疗。汗疱疹给予口服二代抗组胺药，外用溶液进行局部冷湿敷，再用皮质类固醇激素霜膏进行涂抹；2、带状疱疹或者单纯疱疹：是病毒感染性皮肤疾病，要给予抗病毒药物进行治疗，外用、口服阿昔洛韦，经过治疗可以得以缓解；3、真菌感染性疾病：类似于水疱的表现，要给予抗真菌药物进行治疗，比如特比萘芬、联苯苄唑。