真菌性脓毒症是由真菌继发机体感染造成器官功能障碍，免疫力正常患者真菌性脓毒症较为少见，只有在高龄、免疫力低下或长期接受激素免疫抑制剂治疗的患者、器官移植患者、正常黏膜屏障受到破坏或长期使用广谱抗生素造成二重感染、危重症患者较为多见，例如ICU留置较多导管引起导管相关性真菌感染。 免疫状态正常和生理性黏膜没有受到破坏的健康人，真菌性脓毒症感染较少见。高龄糖尿病以及免疫屏障受到破坏的患者，才会存在真菌性脓毒症感染的风险。