耳部CT和耳部核磁的区别是耳部CT主要检查耳朵骨头的结构，而耳部核磁主要检查耳部软组织结构，它们的功能不一样。1、耳部CT：耳朵分外耳、中耳、内耳，外耳通过肉眼能够看到。而中耳主要是骨性结构，比如听小骨、乳突，上述骨性结构则需要通过CT才能看到。高分辨率的螺旋CT可以分辨毫米级的结构，比较适合检查中耳等比较精细的骨质结构和气房，即骨头中间的空隙是否发生病变、是否有病变的侵袭或骨质的破坏；2、耳部核磁：核磁分辨不了骨头，但可以分辨的软组织，比如可以检查出内耳或者神经的畸形、软组织增生的肿物等。核磁可以分辨上述病变的范围，病变与周围的区别以及它的血液供应是否良好、血液走行等情况。另外内听道、脑干等软组织，也需要进行核磁检查才能分辨。但是核磁的分辨率没有CT高，所以检查再精细的结构时，还是需要进行CT的检查。