通常并不通过孕酮值诊断怀孕，而是以HCG即人绒毛膜促性腺激素检查判断是否怀孕。孕酮在怀孕后会有明显上升，但孕酮在黄体期时，同样会有明显上升，二者有较大范围重合，无法找到孕酮的阶段值诊断是否怀孕。通常在怀孕之后，孕酮值超过25ng/mL认为较理想。如果孕酮值<25ng/mL，不代表未怀孕或胚胎发育异常。部分女性在怀孕之后孕酮值长期维持十几纳克每毫升的水平，胚胎发育仍未出现异常。总体而言，在孕酮值较低时，出现胚胎停育以及异位妊娠几率明显增加，但目前找不到恰当的诊断值。