运动后肩膀疼痛，通常见于以下几种原因：1、肩膀肌肉拉伤：运动时肩膀肌肉拉伤，可能会产生肩膀疼痛现象；2、肩袖损伤：运动时动作过猛，出现肩袖损伤，会产生肩膀疼痛；3、颈椎椎间盘突出加重：有颈椎椎间盘突出病史，运动较猛，过于剧烈，可能产生颈椎椎间盘突出加重，导致肩膀疼痛现象；4、软组织损伤或骨折：运动时摔跤，肩膀软组织损伤或骨折，可能产生肩膀疼痛。