如果牙龈旁边长肉疙瘩，应尽早到正规医院口腔科进行检查，依据原因进行相应治疗，主要情况如下：1、牙周疾病：主要是牙龈脓肿或根分叉病变造成，需要进行洁治、刮治，去除牙石，去除根分叉地区的炎症、肉芽组织，控制炎症后，瘘孔可以闭合；2、根尖炎症：需要进行根管治疗，去除已经坏死的牙髓，再进行多次根管换药，炎症控制后再进行根管预备、冲洗、充填，再修复牙冠缺损。还要根据根尖病变大小，判断是单纯进行根管治疗，还是在根管治疗后再配合根尖切除手术，只有根尖炎性病变被彻底控制后，根尖周围瘘孔才能慢慢闭合。