脚趾头起水疱有以下几种常见的原因：1、运动摩擦：运动穿鞋跑步，跑步时间长，脚趾头会磨起疱，因为脚趾头和鞋子的摩擦运动引起起疱的情况；2、脚癣：真菌感染后引起脚癣也会在脚趾头上起疱，会瘙痒；3、热水烫伤：冬天用热水袋，热水烫伤起疱，这是外在因素；4、其他皮肤病：如天疱疮、类天疱疮，可以全身发疱，脚趾头上也会起疱；5、药物：药物过敏后全身会起疱，脚趾头也会起疱。