肠炎是笼统疾病称呼，分类为细菌性肠炎和炎症性肠病导致肠炎。最常见细菌性肠炎，治疗首先确定病原菌，根据病原菌进行抗菌治疗。一般导致肠炎细菌是革兰氏阴性杆菌，治疗首选喹诺酮类抗菌素治疗。 炎症性肠病治疗主要应用5-氨基水杨酸类药物，代表药物主要是美沙拉嗪。炎症性肠病治疗需长程治疗，5-氨基水杨酸类是基础治疗，必要时要加用激素治疗甚至免疫抑制剂治疗。炎症性肠病涉及到免疫系统发病，主要是细菌外界环境作用于感染易感者，启动自身免疫发病，出现迁延不变腹痛、腹泻、黏液脓血便症状，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病。