通常婴儿进行核磁共振检查没有伤害，核磁共振与CT检查不同，不存在射线，因此较为安全。CT有X射线，而临床核磁共振应用相对比较广泛，可对婴儿进行检查，主要进行头颅、胸部及腹部检查，对婴儿影响较小。核磁共振对于软组织显影以及血管显影，比CT更为准确、精准，看到物质更为细微，婴儿进行检查时，应尽量采用核磁共振检查，而非CT。但核磁共振费用相对较高，且核磁共振做检查所需时间相对较长。婴儿无法配合时需采用镇静剂，应使婴儿在配合情况下，进行核磁共振检查。