角膜水肿分多种原因，比较常见的情况是角膜内皮细胞功能失代偿。角膜的内皮细胞起到类似水泵的作用，即不停将角膜中的水释放出来，细胞损伤后水泵工作会停止，角膜会越来越肿。这种原因引起的角膜水肿不会自行消失，只有通过角膜移植或者角膜异体移植才有可能消退。 对于其它原因，比如外伤引起的角膜水肿，经过药物治疗后会慢慢消退。此外，严重的角膜内皮细胞损伤、角膜营养不良，造成的水肿情况不会自行消失。