儿童良性癫痫的原因目前在临床上没有明确的研究清楚，多数学者认为与遗传因素有一定关系，可能存在先天颅内结构或者功能异常，导致大脑皮层异常放电，引起此病。儿童良性癫痫通常在特定区域出现异常放电，男孩比女孩更多见，高发年龄是4-12岁。随年龄增加，癫痫发作的频率会逐渐减少，多数孩子到青春期之后癫痫能够逐渐减轻和消失。儿童良性癫痫也是癫痫的一种，发病因素还可能与后天感染因素以及外界环境干扰因素，比如脑血管因素或者颅内出血、颅内占位等，均有一定的关系。