男性查HPV病毒感染有以下几种方式：1、查体：通过查体可以发现男性包皮、冠状沟及龟头是否有疣状新生物，乳头状肿物或菜花样肿物；2、实验室检查：如通过3%的醋酸局部涂抹乳头状肿物表面，表面在5分钟后变白，通常提示尖锐湿疣阳性，醋酸试验阳性可以诊断为尖锐湿疣；3、DNA-HPV检查：HPV检查可以通过DNA-HPV检查，通常通过局部组织分析后，通过DNA检测来发现有无HPV感染及HPV类型；4、组织病理学检查：通常在外阴局部通过组织活检病理的方式来检测组织中HPV病毒情况，通常可以发现有无HPV病毒感染及HPV病毒感染的类型，还可以预测HPV病毒复发率。