多数情况下，脑部病毒感染可以得到较好治疗，可以治愈，但需根据病毒感染类型和就诊时间早晚决定。现在随着医疗条件的进步，大多数患者有头疼、恶心、呕吐，会及早到医院治疗，所以大部分患者均可以得到有效治疗和缓解。极少数的特殊病例，如乙脑。其病毒比较凶险，患者到医院时已经昏迷，救治的时间比较晚或者诊断时间比较晚，其预后一般不好，有时会出现危及生命的情况，但此类病例比较少见。​多数情况下，一旦有高热或者说胡话等脑部症状的情况下，患者家属往往就会把患者带到医院进行及时救治。总而言之，早期治疗对预后也至关重要。