尿路分叉需根据具体导致分叉的原因，才能做出相应较有效的治疗。尿路分叉较常见的原因为良性前列腺增生，即由前列腺肥大所引起。前列腺肥大的症状较轻时，可进行针对性给药，较常用的5α-还原酶抑制剂，如非那雄胺等，亦常用的有α受体阻滞剂，如特拉唑嗪、坦索罗辛等药物可以让尿道松弛，增大尿道口径，增大尿流率，使尿路分叉得到治愈。在药物治疗效果不理想时，若有手术指征，且病情较重，有血尿、结石、肾积水等并发症时，可以考虑给予患者手术治疗，手术解除梗阻因素后，则梗阻因素导致的尿路分叉亦可得到改善。