扁桃体切除手术是耳鼻喉科最基本、最简单的手术，但也存在一定风险。手术治疗一般推荐不在急性期做，一般要等孩子咽痛症状完全消退以后至少2周以上，再考虑做扁桃体摘除手术。 通常也有一些手术适应症，如1年内孩子扁桃体炎反复发作超过7次或者更多；2年内每年发作扁桃体发炎达到5次以上；3年内每年扁桃体发作超过3次。如果患者并发有扁桃体周围脓肿，还有白喉带菌者经保守治疗无效，或者是有不明原因的低热或扁桃体源性疾病。如伴有扁桃体炎的急性肾盂肾炎或者关节炎出现，还有其它的如扁桃体角化症或有肿瘤都是手术指征。