头盖骨凹陷的常见原因如下：一、生理性凹陷：一般在从小到大缓慢发育过程中逐渐形成，触摸时和周围颅骨硬度相同，并且不会出现明显压痛或触之有波动感、其它异常感觉。二、病理性凹陷：1、颅骨嗜酸性肉芽肿：对于年轻人，特别是一些年轻女性，可以形成颅骨嗜酸性肉芽肿，触之局部形成凹陷，并且在触压时会有明显疼痛，进行抽血化验时可以发现嗜酸性粒细胞增高；2、肿瘤：也可以形成局部凹陷，如颅骨骨髓瘤、转移瘤等；3、感染：如颅骨的骨髓炎等，同样可以形成颅骨局部凹陷。