通常进行脑部核磁共振检查并无任何副作用，因核磁共振不存在射线，对身体、脑部均无损害。但部分特殊患者无法进行脑部核磁共振检查，具体如下：1、幽闭恐惧症：因进行脑部核磁共振检查时空间较小且为密闭空间，患者可感觉较恐惧、无法忍受，无法进行核磁共振检查；2、耳部疾病：因核磁共振声音较小，但部分耳部疾病患者可能会感觉声音较大，无法忍受，此类患者无法进行核磁共振检查；3、恶心、呕吐：进行核磁共振检查时通常采取平卧位，部分患者可出现恶心、呕吐症状，且当患者存在偏瘫情况时，平卧位易引起窒息。