头顶头皮疼的原因如下：1、感染原因：比如疱疹病毒感染、毛囊炎感染等；2、神经原因：比如三叉神经、枕大神经病变；3、代谢性疾病：比如糖尿病损害周围神经；4、颅内病变：比如颅压高的早期表现；5、其它：帽状筋膜病变、皮脂腺病变、寒冷刺激、外伤、疲劳过度等。患者需要在皮肤科、神经科、骨科、神经外科等科室及时就诊，查明原因并对因处理，才能取得较好的临床效果。在未确诊之前，以及没有针对性的综合治疗方案之前，避免滥用止疼片，以免延误病情。