深度睡眠时间短时，患者可以采取以下几种常见的处理方法：1、养成规律的作息习惯：固定上床休息和起床时间。因为熬夜或睡眠的时间过晚会影响患者的深睡眠，晚上11点后再睡觉便会导致深睡眠时间缩短，推荐患者10点上床睡觉，早上6点起床；2、减少白天卧床休息时间：推荐患者白天卧床的时间不超过半小时，增加白天的睡眠负债，便于改善夜间的睡眠质量；3、增加锻炼：肌肉疲劳的感觉也会促进深度的睡眠。同时放松心情，进行肌肉放松的训练，包括冥想等都会促进深睡眠；4、应用药物：必要时可以应用药物促进深睡眠，如盐酸曲唑酮，能够促进深度睡眠，延长深度睡眠的时间。