尿尿的时候肚脐眼疼痛，可以从以下方面进行分析：1、脐炎：尿尿的时候肚脐眼疼痛，多见于本身有脐炎，就是病人本身有肚脐眼的发炎。在排尿的时候，因为腹压增加，可能刚好牵拉到肚脐眼周围神经，可以引起肚脐眼的疼痛。脐炎需要进行处理，主要可以用一些消炎药进行抗炎处理，局部也应该注意换药，以及清除肚脐中的分泌物，保持局部清洁干燥，让创面好起来；2、脐尿管囊肿：还有考虑的是不是存在脐尿管囊肿，尿尿的时候，有的时候可以通过脐尿管囊肿，牵涉到肚脐眼，导致疼痛症状，且脐尿管囊肿多伴有炎症。建议先到医院检查明确是否确实存在脐尿管囊肿，进行适当地抗炎处理以后手术切除脐尿管囊肿，就能够彻底地治疗，因为排尿引起的肚脐疼痛。