两侧肩胛骨疼痛，通常多见于关节炎或者颈椎病，或者肌筋膜炎、肌筋膜劳损等原因，具体如下：1、肩背部肌筋膜炎或者肌肉劳损：通常是由于长时间劳损，低头做事或者肌肉曾经受过外伤、拉伤等因素所造成，通常给予对症治疗即可，无需进行检查；2、颈椎间盘突出：可以刺激和压迫神经，出现放射性的肩胛骨区域疼痛，应该做颈椎的核磁功能检查，判断有没有压迫神经，而导致的双侧肩胛骨区域的疼痛；3、肩关节疾病：肩周炎、肩关节增生、肩袖损伤以及肌腱炎、肩关节骨关节炎、肩峰下撞击征、肩关节的滑膜炎，也可以引起肩关节疼痛；4、肩胛骨肿瘤、占位性病变：也可以造成两侧肩胛骨的疼痛，但两侧肩胛骨同时疼痛，通常不会是肿瘤因素所造成，如果是单侧的肩胛骨疼痛，有可能与肿瘤因素有一定关系。