衣原体也是一种病原微生物，可以感染人体引起相应症状。感染人的衣原体，有肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体、沙眼衣原体。鹦鹉热衣原体往往可以导致患非典型肺炎。沙眼衣原体可以引起眼部感染，眼睛红、结膜充血、眼睛发痒。另外，沙眼衣原体还能引起尿路感染或者生殖系统的感染。肺炎衣原体会引起肺炎、呼吸道症状、肺部感染，病人有发烧、咳嗽、咳痰、干咳、痰少等临床特征。