睡觉醒来头痛常见于以下原因：1、原发性头痛：比如偏头痛、紧张性头痛、丛集性头痛；2、继发性头痛：可以继发于颅内外器质性的疾病，比如全身的系统性疾病，包括发烧、高血压病、代谢中毒性疾病、脑病等。颅内外的器质性疾病也可能会导致继发性头痛，比如脑部肿瘤、脑炎、脑膜炎、头部外伤、蛛网膜下腔出血、硬膜下血肿、脑出血、静脉窦血栓形成等，均可能会导致头疼。通常原发性头痛患者可能病史较长，间断出现，能够自发缓解。继发性头痛病史较短，出现后与既往的头痛性质不同，而且持续不能缓解，此时需到医院就诊。