舌头上长小黑点的原因通常有以下几种：1、色素沉着或色素斑：比较常见。在菌状乳头上长个黑点，就像皮肤的色斑一样，黏膜上也会有色素沉着。通常不需要治疗，舌头不影响美观，也不提示疾病，病因不清楚。多数也不是1个，是好几个菌状乳头上面有色素沉着，因为病因不清楚，也不太需要治疗，可能是生理性的色素沉着；2、口周色素斑肠息肉综合征：如果发生在嘴唇或多个大片的色素沉着，特别是黏膜上也有，要考虑有口周色素斑肠息肉综合征，黏膜是大片的、多个的黑点，口周色素沉着。肠息肉是潜在恶性疾病，有时会恶变，多发生在小孩，要做肠镜明确。