3个月宝宝睡觉经常摇头，常见于以下几方面原因：1、缺乏营养素：可能由于缺乏维生素D或钙导致佝偻病，此时中枢神经系统的兴奋性增高，将导致宝宝睡觉时不安稳且频繁地摇头，同时伴多汗、枕秃，甚至出现方颅、夜间频繁惊醒及哭闹等临床症状。应及时补充维生素D和钙、多晒太阳，则摇头症状将明显好转；2、皮肤病变：可能由于头面部存在湿疹或枕部存在热痱子，导致局部出现瘙痒不适的症状。宝宝睡觉时，潜意识的通过摇头缓解局部不适；3、外耳道异常：比如急性中耳炎、外耳道湿疹，导致局部存在疼痛、瘙痒的感觉，睡觉时通过摇头缓解局部不适的症状。宝宝睡觉时出现摇头，应及时观察其头部是否存在皮疹或外耳道是否存在异常，若均无异常，应注意及时补充维生素D和钙。