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- 渝中
- 肺疾病（包括肺癌、肺气肿、肺大疱、支气管扩张、肺结核等）、食管膈肌疾病（包括食管癌、胃食管结合部或贲门癌、贲门失弛缓症等）、纵隔疾病（纵隔肿瘤、重症肌无力）、胸膜胸壁疾病（包括胸膜间皮瘤、胸腔积液、脓胸、乳糜胸）、胸部创伤等疾病。
- 沙坪坝
- 炎症性肠病（溃疡性结肠炎，克罗恩病）的诊断和治疗，慢性乙肝、丙肝、自身免疫性肝病及肝炎后肝硬化的诊断和治疗。消化道肿瘤（胃癌、结肠癌、肝癌）的诊断和治疗，幽门螺杆菌相关疾病的诊断治疗，胃食管反流病的诊治。
- 沙坪坝
- 消化内科常见和多发病的诊断和治疗，如慢性食管炎、反流性食管炎、胃食管返流病，急、慢性胃炎，胃及十二指肠溃疡，急、慢性肠炎，炎症性肠病，急性肝炎，慢性乙型病毒性肝炎、慢性丙肝，肝硬化，酒精肝及脂肪肝，急、慢性胰腺炎及消化系统肿瘤等。 危重病人的动脉血气监测及其救治，全身炎症反应综合征的概念及发生机制研究，危重病患者急性脏器功障碍的防治，一氧化氮合酶抑制剂抗休克机制的研究，危重病人代谢功能紊乱及防治研究。
