试管婴儿胚胎着床过程与怀孕受精卵着床过程一样，只是通过体外受精胚胎移植技术可以算出着床时间。如果进行新鲜周期的移植，即取卵后第3天通过比较细的管道，将胚胎放至子宫腔内，但并不是马上着床，通常受精卵可能3-5天才开始着床，着床时为侵袭性表现，通过子宫内膜的突破口进入，即应用溶解酶等作用破坏子宫内膜，从而促使受精卵进入。​着床后由于胚胎产生HCG继续刺激黄体产生雌激素和孕激素，从而维持正常妊娠。如果在血中可正常查到HCG一定水平，则说明胚胎种植后着床成功。如果为移植囊胚，则着床过程基本与胚胎着床相同，由于囊胚发育阶段比较晚，因此着床时间较早，通常放至子宫内2-3天后开始着床，可通过溶解酶的化学或物理作用，促使其进入子宫内膜内。如果着床成功，滋养层细胞可分泌HCG刺激黄体继续产生雌激素、孕激素，从而维持正常妊娠，且可在血中检查到HCG正常水平。