头疼尤其是慢性头疼，做核磁共振检查能够查出来，头疼做核磁共振的检查，用来找病因，所以一大部分头痛的病因都会通过核磁共振检查检查出来。比如常见的有脑的肿瘤、脑卒中、脑外伤、脑的寄生虫的感染，以及动静脉的畸形等，这些疾病通过头颅核磁共振的检查，都可以明确诊断。另外还有一小部分头痛的原因，核磁共振无法检查出来，但是核磁共振的检查可以作为一些疾病排除诊断的依据，比如临床常见的颅内感染。第一步是做了核磁共振的检查，除外了一些特殊的疾病，颅内感染通过腰椎穿刺来明确诊断，其他的用于排除依据的一些疾病，比方像偏头痛、紧张性头痛等。