甲状腺过氧化物酶抗体升高提示机体发生了自身免疫性疾病，机体把甲状腺当做抗原，产生了自身抗体，这时主要包括甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺微粒体抗体升高。抗体升高，没有甲状腺功能异常时，患者没有临床症状和体征，这种情况大多数是在体检时偶然发现。在其它的自身免疫性疾病时，这些抗体也有可能升高，包括弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症、类风湿性关节炎、皮肌炎、多发性肌炎、重症肌无力、Still病、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，都有可能使得抗体升高。所以，如果出现抗体升高，要进一步检查相关脏器的疾病，有时是甲状腺疾病，有时可能还不是甲状腺疾病。在桥本甲状腺炎时，甲状腺过氧化物酶抗体升高比较明显，随着疾病进展，可发生甲状腺功能减退症。这是由于随着疾病进展，淋巴细胞逐渐代替了甲状腺组织，使得甲状腺激素的合成、分泌受到抑制，而产生甲状腺功能减退症。发生甲状腺功能减退症时，给予左甲状腺激素替代治疗。在没有发生甲状腺功能减退症时，一般不需要特殊的药物治疗，只需要观察抗体升高的程度以及甲状腺功能是否受到了损伤。